Need antimikroobsed peptiidid tuletati algselt putukate, imetajate, kahepaiksete jne kaitsesüsteemidest ning need hõlmavad peamiselt nelja kategooriat:
1. tsecropiin oli algselt Cecropiamoth'i immuunlümfis, mida leidub peamiselt teistel putukatel, ja sarnaseid bakteritsiidseid peptiide leidub ka seasooles.Neid iseloomustab tavaliselt tugevalt aluseline N-terminaalne piirkond, millele järgneb pikk hüdrofoobne fragment.
2. Xenopuse antimikroobsed peptiidid (mamainiin) saadakse konnade lihastest ja maost.Samuti leiti, et ksenopuse antimikroobsete peptiidide struktuur on spiraalne, eriti hüdrofoobsetes keskkondades.Ksenopuse antipeptiidide konfiguratsiooni lipiidikihtides uuriti N-märgistatud tahke faasi TMR abil.Atsüülamiini resonantsi keemilise nihke põhjal olid ksenopuse antipeptiidide heliksid paralleelsed kahekihilised pinnad ja need võisid koonduda, moodustades 13 mm puuri, mille perioodiline spiraalne struktuur oli 30 mm.
3. defensiini kaitsepeptiidid on saadud inimese polükarüootsete neutrofiilide küüliku polümakrofaagidest, millel on täielik tuumasagara ja loomade soolerakud.Rühm antimikroobseid peptiide, mis sarnanesid imetajate kaitsepeptiididega, ekstraheeriti putukatest, mida nimetatakse "putukate kaitsepeptiidideks".Erinevalt imetajate kaitsepeptiididest on putukate kaitsepeptiidid aktiivsed ainult grampositiivsete bakterite vastu.Isegi putukate kaitsepeptiidid sisaldavad kuut Cys-i jääki, kuid üksteisega disulfiidsideme meetod on erinev.Drosophila melanogastist ekstraheeritud antibakteriaalsete peptiidide molekulaarne disulfiidsilla sidumisviis oli sarnane taimekaitsepeptiidide omaga.Kristallitingimustes esitatakse kaitsepeptiidid dimeeridena.
4. Tahhüplesiin on saadud hobuseraua krabidest, mida nimetatakse hobuserauaks.Konfiguratsiooniuuringud näitavad, et sellel on antiparalleelne B-voltimise konfiguratsioon (3-8 asendit, 11-16 asendit), millesβ-nurk on omavahel ühendatud (8-11 asendit) ja positsioonide 7 ja 12 ning positsioonide 3 ja 16 vahel tekib kaks disulfiidsidet.Selles struktuuris asub hüdrofoobne aminohape ühel pool tasapinda ja kuus katioonset jääki ilmuvad molekuli sabale, seega on struktuur ka biofiilne.
Sellest järeldub, et peaaegu kõik antimikroobsed peptiidid on oma olemuselt katioonsed, kuigi nende pikkus ja kõrgus on erinevad;Kõrgemas otsas, kas alfa-spiraali kujul võiβ-volditav, bitroopne struktuur on ühine tunnus.
Postitusaeg: 20. aprill 2023